微生物多样性云流程操作指南

基础模块

• 第1节

  新手指南

• 第2节

  流程参数设置

• 第3节

  不同批次数据合并

• 第4节

  图形工具栏使用指导

• 第5节

  结果文件查看及下载

• 第6节

  分析管理

• 第7节

  样本信息管理

• 第8节

  Metadata信息管理-环境因子数据管理

• 第9节

  Metadata信息管理-分组管理

• 第10节

  新建分组方案及在线上传

• 第11节

  OTU集管理

• 第12节

  测序信息统计

实战模块

• 第13节

  分类学分析

• 第14节

  pan和core物种分析

• 第15节

  Alpha多样性指数

• 第16节

  多样性指数组间差异

• 第17节

  稀释曲线

• 第18节

  venn图分析

• 第19节

  群落结构组分图

• 第20节

  多级物种sunburst图

• 第21节

  群落heatmap图

• 第22节

  样本与物种关系分析

• 第23节

  TERNARY三元相图

• 第24节

  样本层级聚类分析

• 第25节

  PCA分析

• 第26节

  PCoA分析

• 第27节

  NMDS分析

• 第28节

  多维PCA分析

• 第29节

  ANOSIM/Adonis分析

• 第30节

  PERMANOVA分析

• 第31节

  PLS-DA分析

• 第32节

  菌群分型分析

• 第33节

  多组比较

• 第34节

  两组比较

• 第35节

  两样本比较

• 第36节

  LEfSe差异分析

• 第37节

  MetagenomeSeq分析

• 第38节

  VIF方差膨胀因子分析

• 第39节

  RDA/CCA分析

• 第40节

  db-RDA分析

• 第41节

  相关性heatmap图

• 第42节

  Mantel test分析

• 第43节

  排序回归分析

• 第44节

  VPA分析

• 第45节

  MaAslin分析

• 第46节

  Procrustes分析

拓展模块

• 第47节

  随机森林分析

• 第48节

  ROC分析

• 第49节

  共现性网络

• 第50节

  物种相关性网络

• 第51节

  双因素相关性网络

• 第52节

  系统进化树

• 第53节

  个性化系统发生进化树

• 第54节

  PICRUSt1功能预测

• 第55节

  PICRUSt2功能预测

• 第56节

  Tax4Fun功能预测

• 第57节

  FUNGuild功能预测

• 第58节

  BugBase表型预测-表型预测

• 第59节

  BugBase表型预测-物种-表型贡献度分析

• 第60节

  BugBase表型预测-表型组间差异检验

• 第61节

  FAPROTAX功能预测-功能预测

• 第62节

  FAPROTAX功能预测-功能组间差异检验

• 第63节

  MICROPITA分析